PPPGL mempunyai tugas menyelenggarakan penelitian dan pengembangan bidang geologi kelautan. Dalam melaksanakan tugasnya PPPGL menyelenggarakan fungsi-fungsi :

1. Perumusan pedoman dan prosedur kerja;
2. Perumusan rencana dan program penelitian dan pengembangan berbasis kinerja;
3. Penyeleggaraan penelitian dan pengembangan pemetaan geologi, geokimia, dan geofisika kelautan, serta pengelolaan sarana dan prasarana penelitian dan pengembangan;
4. Perumusan rekomendasi batas landas kontinen Indonesia;
5. Pengelolaan kerja sama kemitraan penerapan hasil penelitian dan pelayanan jasa teknologi, serta kerja sama penggunaan sarana dan prasarana penelitian dan pengembangan;
6. Pengelolaan sistem informasi dan layanan informasi, serta sosialisasi dan dokumentasi hasil penelitian dan pengembangan teknologi;
7. Penanganan masalah hukum dan hak atas kekayaan intelektual, serta pengembangan sistem mutu kelembagaan penelitian dan pengembangan teknologi;
8. Pembinaan kelompok jabatan fungsional Pusat;
9. Pengelolaan ketatausahaan , rumah tangga, administrasi keuangan, dan kepegawaian pusat;
10. Evaluasi pelaksanaan penelitian dan pengembangan bidang geologi kelautan